Qué raro a mí no me pasa eso, puede ser que estés deseleccionando la herramienta Cut con clic derecho antes de acabar total mente el recorrido del corte, si es así al crea un corte en medio de un polígono donde no había una Edge y dejarlo sin concluir, te crea un corte que uno no hizo, por eso presiona clic izquierdo hasta terminar la totalidad del recorrido y al acabar clic derecho para dejar de cortar.
Porque no veo que estés haciendo nada mal en el video ojalá y sea la respuesta a tu problema.