Bueno, como lo que he entendido es que quieres modificar la imagen que ya tienes creada para suavizar esos bordes, con el
Adobe Photoshop, a mi lo que se me ha ocurrido es lo siguiente: (es más tedioso de explicar y de leer que de hacer, no se tarda nada en modificarlo).
1-te creas una capa nueva (manchas nuevas)
2-con la varita mágica seleccione una mancha en la capa original.
3-haces un Smooth de la selección en unos 10 píxeles y luego un expand de la misma selección en un par de píxeles (desesperados valores los eliges en función de tu gusto y de tu resolución de la textura)
4-seleccionas el color de la mancha.
5-te vas la capa que has creado antes y rellenas la selección con el color de tu mancha.
Tiempo de ejecución 20 segundos por mancha, así te curras este procedimiento por cada mancha y en cinco minutos lo tienes hecho si el resultado que pides no es que sea especialmente preciso.
Te adjunto una imagen de cómo queda las manchas que he modificado de esta manera (las encerradas por la línea rosa). Un saludo, espero que te sirva.