Vaya, en meses que llevo con esto, no había encontrado ninguna respuesta... hasta que he venido aquí a preguntar y he seguido mirando en algunas páginas.
Bien, esto es pues:
Parece ser que no hay forma de eliminar la información vertex color (hasta la 2.83, por lo menos.Y parece que en la 3, tampoco). Así que hay que hacerlo a través de Python, con esto:
	Código:
	import bpy def remove_vertex_paint(gpencil: bpy.types.GreasePencil):
    for layer in gpencil.layers:
        for frame in layer.frames:
            for stroke in frame.strokes:
                stroke.vertex_color_fill = [0.0, 0.0, 0.0, 0.0]
                for point in stroke.points:
                    point.vertex_color = [0.0, 0.0, 0.0, 0.0]
for gp in bpy.data.grease_pencils:
    remove_vertex_paint(gp)
 Mano de santo. Lo he encontrado en https://blender.stackexchange.com/qu...-vertex-colors