Transparencia en Cycles y como bakear

Hola. Trabajo con Blender 3.5.1
Cycles no me aplica la transparencia correctamente. En principio deberia ser suficiente con definir elAlpha del Principled a 0 para que el objeto fuera transparente pero en un archivo en concreto no funciona bien. He abierto un archivo nuevo he añadido el objeto con material transparente y parece funcionar tanto en Cycles como en Eeve
El material transparente es para ventanas, el marco es blanco y la parte del vidrio transparente, hasta ahi bien. Los objetos son dos, una puerta y las ventanas del autobus. Los dos objetos me sirven para generar mapas de normales que aplicados a un plano me simulan el relieve, hasta ahi bien
La idea es bakear los materiales de los objetos, blanco para los marcos de las ventanas, amarillo para una parte de la puerta y los vidrios transparentes, y ahi me encallo
No encuentro la manera de bakear la transparencia
He visto algunos temas pero no acabo de pillarlo
Podeis ayudarme?
Gracias