Cortar intersección y unión de polys

Hola, soy nuevo en el tema y quisiera saber si se puede moldear un polígono de acuerdo a otro, es decir, supongamos que tengo un box que lo paso a poly, y luego hago un tubo el cual lo pongo de modo que atraviese el box al medio de todas sus caras, hay forma de que en el box (ya echo poly) se perforen en sus interiores como así también en sus caras la forma del tubo?
Esto viene porque estoy haciendo una figura complicada y necesito cortarla de tal forma, que lo podría hacer con otra figura geométrica, pero no sé cómo, muchas gracias por adelantado, espero haberme expresado correctamente.

Hola, la verdad podrías usar bolean, pero la verdad es que, al menos yo, no puedo controlar en donde van a salir los cortes, yo prefiero crear los cortes, aquí te adjunto una imagen que explica como lo haría yo, si es que entendí bien tu pregunta.

Espero te sirva de ayuda. Saludos.

-- IMÁGENES ADJUNTAS --

Voy a intentar como pones ahí, pero si alguien sabe de algún método poco conocido que lo diga, saludos y muchas gracias por tu idea Ardozea.