El boolean substraction me hace cosas raras

Buenas. Estoy con el 3d Studio max9. La cuestión es la siguiente: tengo un polígono y quiero quitarle un trozo de otro polígono. Y al darle substraer (a-b) me lo resta, pero me deja la malla abierta. Nunca antes me había sucedido esto. ¿alguien sabe a qué se debe?
Dejo unas imágenes para que os hagáis una idea:
-este es un lado donde me funcionó correctamente:

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Adjunto #62150

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Este es el otro lado, donde hago exactamente lo mismo con otro cuadrado de otras dimensiones, pero lo mismo en esencia. Como veis me lo hace mal, se ve el interior del polígono:

Necesito de vuestra sabiduría.

-- IMÁGENES ADJUNTAS --

Vaya, pues, inténtalo de nuevo, o prueba con el ProBoolean.

Las booleanas, al menos en mi opinión, no son un buen negocio. Mi consejo, viendo la Autodesk Maya, es que muevas la geometría manualmente, así evitaras que la Maya se te ensucie y este más ordenada, lo cual para animar y texturizar es importante.

Quieres eliminar un cuadrado, o eso parece, puedes eliminar unas cuantas caras y luego rotarlas hasta que queden en la posición que quieras. Aunque no sé exactamente qué quieres hacer. Saludos.

Amigo selecciona los polígonos de un lado, y luego los mismos del otro lado, luego en editpoly>poligon dale a bridge y listo, no uses booleans.

Gracias por los consejos. Al final he usado bolean, pero sólo para marcar el cuadrado que me ineresaba sobre la Maya. Luego modifiqué la Maya manualmente.

Probé lo de bridge, pero no conseguía que me quedará como yo quería, pero me será útil en otros momentos. Gracias a todos.