Al fusionar un Biped en otra escena, lo sitúo donde quiero y al cambiar de viewport el Biped vuelve a su punto de origen.
Lo que debes hacer es: en el menú del bípedo, en la pestaña layer (capa) te creas una nueva, le das al botón de animar, lo colocas donde quieres, colapsas la capa y ya está (creo). Saludos.