¿En que fase estas? ¿huesos de geometría o de control? Si es lo primero, debes crear una pose para ubicar allí las constraints principales. Algunos se crean carpetas y subcarpetas para separar áreas del cuerpo. Eso es a gusto de cada quién y la interfaz lo permite. Hay otros constraints que se pueden añadir en actions o en la choreography, pero ya cuando se está animando.
Descárgate los tutoriales traducidos del cole, de la sección setup, te aclararan muchos puntos.
Te dejo una captura para que vayas teniendo una idea. En este caso son constraints que he hecho para configurar fan Bones. Aunque este Rig es el tsm2 de Anzovin le he aplicado los huesos intermedios según la técnica del CD humanoide del cole3d, net. Un saludo, Shazam.
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