No sé a qué te refieres a los de los puntos X Y Z pero si el problema es que has cambiado algún valor de blender sin darte cuenta, siempre puedes volver a dejarlo como viene de la descarga oficial, con File > Defaults > Load Factory Settings.
Una vez hecho esto, puedes colocar las ventanas como tu quieres y al final eliges la opción que hay al lado mismo: File Defaults > Save Starup File para que se guarde esa nueva configuración y siempre que se abra Blender sea con esa nueva configuración.
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