El retargeting de animación es una característica que permite reutilizar animaciones entre personajes que utilizan el mismo recurso, pero pueden tener proporciones muy diferentes. A través del retargeting, puede evitar que los esqueletos animados pierdan sus proporciones o se deformen innecesariamente al usar animaciones de personajes de diferentes formas. Con Animation Retargeting también es posible compartir animaciones entre personajes que utilizan diferentes activos de esqueleto siempre y cuando compartan una jerarquía ósea similar y usen un activo compartido llamado Rig para pasar datos de animación de un esqueleto al otro.
Yo creo que deberías mirarte estas instrucciones donde comentan
fallos similares al que expones. Un saludo.