Pues será que tienes mal asignados los vértices.
Para mirarlo, puedes ponerte en EIT MODE (me refiero al cuerpo u objeto), así verás los vértices.
Luego vas a lo que es el Vertex Group y vas seleccionando hueso a hueso y presionado (SELECT) para ver los que tienes seleccionados.
Si, por ejemplo, tienes mal el grupo, solo tendrás que seleccionar los que estén MAL y presionar el botón de REMOVE. En el mismo momento no verás cambios, pero de-seleccionas todo (letra A) y vuelve a presionar SELECT para ver los que tienes seleccionados.
Al principio es un poco lío eso de seleccionar, de-seleccionar, asignar y remover, pero con un poco de práctica podrás hacer que te queden bien asignados esos vértices a cada hueso de tu cuerpo.
Decir, que si los tienes por nombre, te va a ser más fácil.
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