Tema: Sugerencias con modelos stl abiertos

Buenas, acudo a vosotros porque estoy realizando mi trabajo final de grado de ingeniería el cual consiste en la simulación aerodinámica de diferentes coches por ordenador. Para esto he cogido diferentes modelos de Internet, pero todos presentan el mismo problema, tienen agujeros que hacen que al mallar, esta se cuele dentro del coche. Es decir, el programa de simulación acaba simulando el interior y el exterior del coche a causa de que los modelos no son impermeables falseando las simulaciones. He probado con MeshLab, polyMender, netfabb etc, pero o no consigo tener una superficie cerrada o me distorsiona completamente la geometría (o ambas). Hay que señalar también que mi nivel en esto es prácticamente nulo puesto que el único diseño por ordenador que he tocado en ingeniería ha sido más enfocado al diseño de planos que otra cosa, así que, si alguien pudiese echarme un cable le estaría enormemente agradecido. Muchas gracias por su tiempo de antemano.

Si, los tengo en ese tipo de formatos. Ya los he intentado manipular antes con Blender, pero sin éxito. Entre que no me pareció intuitivo y que no tengo conocimientos no seguí por esta vía, ya qué ponerme a mirar diversos tutoriales para qué después el resultado no fuese el deseado como con la resta de programas, me echó para atrás. Ahora bien, si me dices que Blender es la solución me pondré a ello. La verdad es que cualquier agujero o fisura puede hacer que falle el mallado. Hay un comando en Linux que te separa él archivo stl en partes in-conectas y supongo que, es lo que tú te refieres con lo de las puertas, con la diferencia qué pueden salir hasta 200 piezas diferentes así que, no sé, me recomiendas que me mire tutoriales de Blender?

No, en teoría no volvería a tocar modelos 3D. Pero si no hay otra alternativa qué remedio. De todas formas, si invierto tiempo podre cerrar los modelos? (No me considero un patoso con los ordenadores, pero también es cierto que partiré de 0).

Ya he empezado con tutoriales, el addon meshlint detecta los agujeros? O hay otro addon que lo haga?

Bueno después de unas 3h de tutoriales en youtube.
1) Cuando sigo los pasos de instalación para MeshLint y pongo el nombre en el buscador no me aparece el addon, como si aparece en esta fotografía de la wiki.

2) Probando lo de select Non_Manifold me han pasado dos cosas. La primera qué el coche esta dividido en subpartes y cuando cojo más de una subparte no me permite pasar el modo edición, por tanto, aunque consiga sellar cada una de las partes si después entre ellas están sin sellar seguiré teniendo el mismo problema. Segunda, probando el comando Non_Manifold con diversas subpartes la gran mayoría de los elementos que quedan seleccionados están en las partes exteriores que están en contacto con la resta de subpartes, no hay algún modo de unirlo todo en el mismo conjunto? O alguna otra manera de lidiar con esto. Muchas gracias por tu tiempo, saludos.

Posdata: por si sirve, el modelo sobre el que estoy intentando trabajar es este http://tf3dm.com/3d-model/bmw-x6-88410.html.