Tema: Rellenar esquina partiendo de la misma malla

Que me corrijan los que saben, pero eso es porque al extruír las caras tendrás activada la opción by poligon. Usa una de las otras.

Si quieres que te quede cuadrado y correcto: Extruye una de las dos caras internas del hueco, luego borra las caras que quedan pegadas y soldar los 4 vértices que sobran.

Mira la imagen a ver si se entiende.

Tal ves tendrías que tener activada la opción grupo de polígonos(va creo que es esa) fíjate te vas a dar cuenta de cual es y si no borras los dos polígonos que se encuentran y cras otro con los vértices que quedan lo retocas y listo:p (suena complicado, pero es cosa de 3 segundos si sos lento).