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Buenas. Aquí una animación que he hecho para probar el After Effects (que estoy aprendiendo).
http://www.youtube.com/watch?v=h3frm_57jsi
Esta renderizado por capas, el deposito y las enredaderas con Maxwell, la valla con Scanline. El humo es FumeFX, y las nubes de fondo también están insertadas en After.
He visto que para manipular audio After Effects no es lo mejor.
Para manipular audio en After Effects, lo mejor es usar Adobe Audition ya que está integrado en el ecosistema Creative Cloud y es la herramienta profesional para ello. Si buscas una opción gratuita y potente, te recomiendo Audacity, que es muy completo para edición y mezcla de audio.
Otra alternativa excelente dentro de Adobe es Premiere Pro, que maneja audio de forma más robusta que After Effects y es ideal si ya estás trabajando con video. Para proyectos donde el audio es complejo, siempre es mejor procesarlo por separado en un software dedicado y luego importar el archivo finalizado a tu composición de After Effects.