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Hola cuando tienes tu modelo y comienzas a agregarles Bones hay alguna forma más predica de introducirlos en el interior de tu modelo. Lo digo, porque, por ejemplo, si estás trabajando en perspectiva y colocas el ratón donde crees que va el hueso, luego resulta que cuando pasas a otras vistas el hueso está en otro lado y así se desespera uno.
En ningún software debes colocar Bones desde perspectiva pues pasa lo que te pasa. Lo que se suele hacer es, poner tu vista en modo wireframe o a tu modelo activarle el trough, luego poner los Bones de las piernas y columna desde una vista lateral (derecha, izquierda) luego los colocas en su lugar correcto desde la vista frontal, luego los Bones de los brazos los puedes colocar desde top y los arreglas en front, recuerda también que puedes hacerle mirror a los Bones, entonces solo haces los Bones de la parte derecha y los duplicas a la parte izquierda. Suerte.
Lo que dice Warex es muy correcto. Añadir una cosa. Conviene dar una ligera orientación al 3ds Max de hacia dónde va a rotar, por ejemplo, el brazo o la rodilla. Así cuando pongas el IK o cinemática inversa, evitaras que 3dsmax interprete cosas raras. Vamos, que no pongas los huesos rectos, sino que, ya un poco girados en la dirección en que rotaran, puede parecer obvio, pero si no lo haces te pueden surgir problemas. Un saludo.