Es complicado contestar sin saber que programa estas usando, sin ver el archivo etc, si estas en max prueba a resetear con XForm, o a mover el gizmo de transformacion hasta qué se solucione ese problema, basicamente está así porque en algún paso lo has cambiado, o has modelado desde una caja qué estaba en la orientación que te marca el cuadrado blanco.
Cierto amigo, perdóna uso el 3ds Max 8.
Pues XForm ya está solucionado muchas gracias, este modificador lo usé en su momento, pero no me acordaba cual modificador era y estuve par de horas mirando y no lo encontraba. Gracias.