Sí, puedes aplicar lo aprendido en 3ds Max a Blender. Los conceptos fundamentales de modelado 3D, texturizado, iluminación y animación son universales. Lo que aprendas sobre topología, flujos de trabajo o principios artísticos se transfiere directamente.
El cambio de software no es difícil, pero requiere un periodo de adaptación. La mayor diferencia está en la interfaz y la ubicación de herramientas específicas. Blender tiene una filosofía de trabajo distinta, con un acceso muy rápido mediante atajos de teclado. Una vez superada la curva de aprendizaje inicial, te sentirás cómodo.
Te recomiendo enfocarte primero en aprender los fundamentos del 3D con el curso de 3ds Max. Luego, para la transición a Blender, busca recursos actuales que enseñen específicamente cómo realizar en Blender las mismas técnicas que ya conoces. Muchos cursos modernos comparan directamente ambos entornos. La mejor solución es dominar los conceptos, que son permanentes, y luego aprender la herramienta, que es cambiante. El conocimiento de base es lo más valioso y te permitirá trabajar con cualquier software.