Hola amigos del foro, dejo en este, el siguiente enlace http://www.thedour.net/scripts/ donde encontraran un script muy bueno y gratis para hacer imágenes anaglifas (stereoscopia) de manera muy fácil. Espero les sirva como a mí. Saludos.
Un poco de información http://es.wikipedia.org/wiki/anaglifo.