Duda basica de rigg controlador escala
Hola. La solución puede ser fácil, todo depende de tu rig, mi consejo es que cojas el Joint root (el que seleccionada toda la jerarquía de huesos) + los IK handles (si los utilizas).
Y haces un grupo, luego el pivot del grupo tiene que estar centrado al personaje y tocando el suelo, solo tendrás que escalar el grupo y todo debería escalarse sin problemas, por lo que comentas en tu mensaje el problema es que escalas directamente los huesos y eso puede provocar problemas. Un saludo.
Esperando noticias de Autodesk.